Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NcstnP57716 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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