Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms