Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdgP56581 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms