Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms