Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3bp1P55194 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3bp1P55194 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3bp1P55194 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3bp1P55194 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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