Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NcanP55066 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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NcanP55066 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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