Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrlP54846 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrlP54846 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms