Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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RabggtbP53612 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RabggtbP53612 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RabggtbP53612 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RabggtbP53612 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms