Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms