Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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