Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psen1P49769 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms