Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpreP49446 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpreP49446 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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