Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms