Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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