Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx2P48379 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx2P48379 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms