Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfx1P48377 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms