Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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