Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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