Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nedd4P46935 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd4P46935 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms