Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms