Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighmbp2P40694 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighmbp2P40694 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms