Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms