Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptk2P34152 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptk2P34152 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms