Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola2P33611 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pola2P33611 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms