Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc5P32043 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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