Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa10P31310 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms