Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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