Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms