Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms