Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms