Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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