Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HdcP23738 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HdcP23738 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HdcP23738 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms