Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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