Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RarbP22605 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RarbP22605 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms