Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk1P22518 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clk1P22518 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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