Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lmnb2P21619 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb2P21619 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms