Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms