Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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