Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VimP20152 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VimP20152 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VimP20152 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VimP20152 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VimP20152 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VimP20152 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VimP20152 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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