Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms