Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc1P19123 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms