Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18533 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18533 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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