Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxb1P17919 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxb1P17919 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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