Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme1P15532 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme1P15532 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms