Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms