Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp1P11103 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms