Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms