Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms