Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms