Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itgb1P09055 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itgb1P09055 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb1P09055 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itgb1P09055 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itgb1P09055 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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